氟塑料磁力泵的效率是機械、容積和水力三種效率的乘積。泵組的效率為泵效率和電機效率的乘積。造成氟塑料磁力泵效率低的因素主要有以下幾個。
　　1.泵本身效率是最根本的影響。同樣工作條件下的泵，效率可能相差15％以上。
　　2.氟塑料磁力泵的運行工況低于泵的額定工況，泵效低，耗能高。
　　3.電機效率在運用中基本保持不變。因此選擇一臺高效率電機致關重要。
　　4.機械效率的影響主要與設計及制造質量有關。泵選定后，后期管理影響較小。
　　5.水力損失包括水力摩擦和局部阻力損失。泵運行一定時間后，不可避免地造成葉輪及導葉等部件表面磨損，水力損失增大，水力效率降低。
　　6.泵的容積損失又稱泄漏損失，包括葉輪密封環、級間、軸向力平衡機構三種泄漏損失。容積效率的高低不僅與設計制造有關，更與后期管理有關。泵連續運行一定時間后，由于各部件之間摩擦，間隙增大，容積效率降低。
　　7.由于過濾缸堵塞、管線進氣等原因造成氟塑料磁力泵抽空及空轉。

　　另外，在泵啟動前，操作人員不注重氟塑料磁力泵啟動前的準備工作，暖泵、盤泵、灌注泵等基本操作規程執行不徹底，會造成泵的氣蝕現象，從而引起泵噪聲大、振動大、泵效低。